直屬單位
- 監(jiān)測中心
- 環(huán)科院
- 國際合作中心
- 宣教中心
- 核管中心
- 固管中心
- 生態(tài)環(huán)境評估中心
- 生態(tài)環(huán)境監(jiān)控中心（信息中心）
- 應急中心
- 南京環(huán)境監(jiān)測中心
- 無錫環(huán)境監(jiān)測中心
- 徐州環(huán)境監(jiān)測中心
- 常州環(huán)境監(jiān)測中心
- 蘇州環(huán)境監(jiān)測中心
- 南通環(huán)境監(jiān)測中心
- 連云港環(huán)境監(jiān)測中心
- 淮安環(huán)境監(jiān)測中心
- 鹽城環(huán)境監(jiān)測中心
- 揚州環(huán)境監(jiān)測中心
- 鎮(zhèn)江環(huán)境監(jiān)測中心
- 泰州環(huán)境監(jiān)測中心
- 宿遷環(huán)境監(jiān)測中心